Sản xuất nông nghiệp Trấn Yên đã có chuyển biến tích cực, ứng dụng công nghệ cao vào sản xuất ngày một phát triển. Đặc biệt, việc ứng dụng nông nghiệp hữu cơ, sản xuất hàng hóa có giá trị cao, bảo đảm an toàn thực phẩm trong sản xuất cây ăn quả, cây ăn quả có múi… ngày một nhiều.
Hiện nay, huyện đã mở rộng và phát triển vùng sản xuất cây ăn quả có múi trên 762 ha, giá trị thu nhập đạt cả trăm tỷ đồng mỗi năm. Mỗi héc – ta cây ăn quả có múi thu nhập từ 200 – 250 triệu đồng/năm không còn là chuyện hiếm”. 

Quýt đường canh Hưng Thịnh – Trấn Yên – Yên Bái là giống quýt được trồng lâu năm tại xã Hưng Thịnh, huyện Trấn Yên, tỉnh Yên Bái. Thời gian thu hoạch từ tháng 11, tháng 12 năm trước đến tháng 1 năm sau. Đặc điểm của giống quýt này khi chín muộn có mầu đỏ đậm; Quả hình cầu hơi dẹp, vỏ mỏng, nhẵn; Mùi thơm thanh mát; Thịt quả mọng nước, ít hạt, vách múi hơi dai, ít xơ bã, ngọt đậm.